Naerulinnu lasteaia maja on 2 korruseline ja ehitatud 1953. aastal. Aastatel 1953-1976  asus majas 8- klassiline kool. 1976. aastal tehti kapitaalremont ning rekonstrueeriti maja ümber 140 kohaliseks Paldiski lastepäevakoduks nr 2. 1993. aastal tehti esimene samm eestikeelse lasteaia rajamiseks Paldiskis ning see maja sai ka uue nime Paldiski lastepäevakodu nr 3. Eestikeelseid rühmi oli esialgu ainult üks ning ülejäänud olid vene rühmad. Alates 1995. aastast on eestikeelsete rühmade arv tõusuteel olnud, millal majas oli juba 2 eestikeelset rühma. 1996. aastal sai lasteaed uue nime – Paldiski lastepäevakodu Naerulind. 1996. aastal jäi  lasteaeda vaid üks vene rühm ning ülejäänud olid eesti rühmad. Alates 1999. aastast kannab lasteaed nimetust Paldiski Lasteaed Naerulind.

  1. aastal kolis ka viimane vene rühm üle vene lasteaeda ning nüüdseks töötab lasteaias 6 rühma.
  2. aastal alustati lasteaia renoveerimistöödega ning sellega tehti algust üleüldisele lasteaia remondile. Viimane suurem remont teostati 2013. aastal, mille    käigus ehitati ümber enamus rühmade ruume. 2013. aastast töötab lasteaias 6 rühma ning lasteaed võtab vastu lapsi alates vanusest 1,5 aastat.

2023. aastal tähistab lasteaed oma 70. sünnipäeva.